Сектор осуществляет координацию деятельности по научно-техническому сопровождению Конвенции по сохранению водно-болотных угодий (Рамсарской конвенции), Конвенции о биологическом разнообразии, Конвенции по сохранению мигрирующих видов диких животных(Боннская конвенция).
 
Сопровождение Рамсарской конвенции. На основании исследований, выполненных ГНПО «НПЦ НАН Беларуси по биоресурсам», специалистами сектора был обоснован список потенциальных Рамсарских угодий Беларуси, описаны и получили статус Рамсарских территорий восемь наиболее значимых водно-болотных угодий Беларуси. В результате научных исследований, проведенных сектором, была обоснована международная значимость низинных болот и пойм рек уникального биогеографического региона Полесья для сохранения глобально значимого биоразнообразия. Сектор выступил одним из инициаторов проведения первых международных конференций по сохранению водно-болотных угодий Полесья, благодаря которым низинные болота и поймы рек Полесья приобрели международную известность.
Одним из важнейших достижений сектора явилось инициирование и создание системы реального управления Рамсарскими территориями и другими наиболее значимыми водно-болотными угодьями Беларуси. До 2000 года в Беларуси отсутствовала практика разработки и реализации планов управления, как метода организации устойчивого использования водно-болотных угодий. В рамках реализации международного проекта “ManagementPlanningforConservationofFenMireBiodiversityinBelarus, DarwinInitiative (UK), RSPB (UK); UNDP – UNOfficeinBelarus, BirdLifeBelarus, Минприроды Республики Беларусь) под научным руководством А.В. Козулина были разработаны и частично реализованы планы управления для трех крупнейших в Европе низинных болот – мест обитания более 50% мировой популяции глобально угрожаемого вида птиц вертлявой камышевки. Реально достигнутые успехи по оптимизации гидрологического режима этих болот и стабилизации численности вертлявой камышевки и экосистем низинных открытых осоковых болот послужили примером успешного управления охраняемыми природными территориями.
В значительной степени благодаря разработке и реализации планов управления заказниками «Споровский», «Званец» и «Дикое» в Министерстве природных ресурсов и охраны окружающей среды РБ приняло решение о создании структур управления для 20 наиболее значимых особо охраняемых природных территорий Беларуси.
Одной из важных экологических проблем для Беларуси и других стран Восточной Европы является существование значительного количества болот, нарушенных в результате добычи торфа и лесной мелиорации. Большинство из этих болот практически не используется и подвержено торфяным пожарам, в результате чего в атмосферу выделяются значительные объемы диоксида углерода. С целью решения этих проблем руководителем сектора А.В. Козулиным совместно с RSPB разработан, а с 2006 года начал реализовываться проект ПРООН-ГЭФ, направленный на реабилитацию нарушенных болот. За период с 2007 по 2010 гг. восстановлено 15 нарушенных болот с общей площадью около 28000 га. В рамках данного проекта под руководством Козулина А.В. создана нормативно-правовая база по обеспечению устойчивого использования нарушенных болот, разработаны прогрессивные методы их восстановления. Внедрение этих методов позволило распространить опыт устойчивого использования нарушенных болот на другие территории.
 
Сопровождение Конвенции по биологическому разнообразию. Одним из достижений сектора является разработка и научное сопровождение проекта ПРООН-ГЭФ «Интеграция вопросов сохранения биоразнообразия в политику и практику территориального планирования в Беларуси». В рамках данного проекта проводится инвентаризация биологического разнообразия в 10 пилотных районах Беларуси, и на основе полученных данных – разработка схем землеустройства этих районов, проектов лесохозяйственной деятельности и проектов ведения охотничьего хозяйства. Кроме того с целью повышения эффективности охраны видов животных и растений, включенных в Красную книгу Республики Беларусь предусмотрено внесение дополнений и изменений в законодательные, нормативные и правовые акты Республики Беларусь. Так, в проект Закона «Об охране окружающей среды» включены такие понятия, как редкие и находящиеся на грани исчезновения биотопы, предложены механизмы их охраны и устойчивого использования. Разработаны требования по охране редких и находящихся под угрозой уничтожения видов животных и растений, предложения по ведению лесохозяйственной деятельности в местах обитания видов-краснокнижников, внесены изменения и дополнения в планы действий по сохранению редких и находящихся под угрозой уничтожения видов – вертлявой камышовки, дупеля и большого подорлика, а также разработаны новые планы действий по сохранению таких видов как сизоворонка, луток, большая выпь, лосняк лозеля и гроздовник ромашковидный.
 
 
Сопровождение Конвенции по сохранению мигрирующих видов диких животных (Боннская конвенция).Специалисты сектора являются инициаторами ряда проектов и действий по сохранению и устойчивому использованию мигрирующих видов птиц. Так, в 2011 году подготовлены предложения по взятию под охрану основных мест концентрации водно-болотных видов птиц в период весеннего пролета и миграции. На основании проведенных исследований выделено 40 ключевых территорий, важных для отдыха и кормежки водоплавающих птиц в период пролета, из которых уже на одинадцати, в 2012 году запрещена весенняя охота. Эту работу планируется продолжить в последующие годы.
Сектор активно сотрудничает и выполняет совместные проекты с международными общественными и иными организациями, деятельность которых направлено на сохранения биоразнообразия – Представительство ООН в Беларуси, Глобальный экологический фонд, ЮНЕСКО, Всемирный фонд природы, Darwin Initiative, RSPB (Великобритания), ОМРО (Франция), а также с национальной общественной организацией, деятельность которой связана с вопросами охраны окружающей среды - ГА «Аховой птушак Бацькаўшчыны».  
 
 
Деятельность сектора направлена на поддержание сотрудничества в вопросах природоохранной деятельности с сопредельными странами Россией, Литвой, Латвией, Украиной, Польшей. При участии специалистов сектора подготовлено и подписано Соглашение о сотрудничестве в области охраны и устойчивого использования трансграничных природоохранных территорий между Министерством природных ресурсов и охраны окружающей среды Республики Беларусь и Министерством окружающей среды Латвийской Республики.
В рамках Программы Европейского инструмента добрососедства и партнерства на 2007-2013 годы (программа трансграничного сотрудничества Латвия - Литва – Беларусь)   подготовлен и утвержден проект «Установление трансграничная охраняемой природной территории «Аугшдаугава-Браславские озера» и создание предпосылок для интегрированного природопользования», целью которого является объявление трансграничной белорусско-латвийской особо охраняемой природной территории и разработка согласованного плана управления ею.
Значительный вклад специалисты сектора внесли в создание первых трансграничных водно-болотных угодий между Беларусью и Литвой, а также Беларусью и Украиной. В рамках совместного белорусско-литовско-российского проекта, финансируемого ОМРО (Франция), были выявлены и описаны семь наиболее значимых трансграничных водно-болотные угодий, расположенных на границе Беларусь - Литва. Благодаря согласованным действиям сотрудников сектора с заинтересованными литовскими специалистами на базе заповедника «Чапкяляй» (Литва) и республиканского заказника «Котра» создано одно из первых в Европе трансграничных Рамсарских угодий «Котра-Чепкеляй». Разработано обоснование для подачи заявки на создание трансграничной Рамсарской территории «Вилейты» (Беларусь) - «Адутишкис» (Литва).
На основе анализа состояния водно-болотных угодий в трансграничной полосе Беларусь-Россия подготовлена и обсуждена с российской стороной концепция Программы Союзного государства «Охрана и устойчивое использование водно-болотных угодий в трансграничном регионе Россия-Беларусь для сохранения водных и биологических ресурсов, биоразнообразия и предупреждения торфяных пожаров».
В рамках трехстороннего белорусско-литовско-украинского проекта «Сохранение биоразнообразия на трансграничных участках пойм рек Припять и Днепр между Беларусью и Украиной» разработаны предложения по сохранению трансграничных белорусско-украинских водно-болотных комплексов, а также предложения по сохранению и устойчивому использованию пойм р. Припять и Днепр с учетом поддержания водно-болотных видов птиц. Финансирующая организация - Мигрирующие птицы западной Палеарктики («ОМПО»).
Специалисты сектора принимают активное участие в международных совещаниях и рабочих встречах, связанных с реализацией природоохранных конвенций и сотрудничеством в природоохранной сфере.
Разработаны и в настоящее время реализуются три крупных проекта ПРООН-ГЭФ с общим финансированием 4,7 млн. долларов США: восстановление нарушенных болот, внедрение принципов сохранения биоразнообразия в территориальное планирование и устойчивое использование торфяников;
Разработаны планы управления для 6 ООПТ, 8 планов действий по сохранению видов, занесенных в Красную книгу Республики Беларусь, восстановлены 15 нарушенных болот с общей площадью около 28000 га, усовершенствована законодательная база по сохранению биоразнообразия.